Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tfap2eQ6VUP9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms