Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms