Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc57Q6PHN1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms