Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc35e3Q6PGC7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc35e3Q6PGC7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms