Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trak1Q6PD31 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms