Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Senp6Q6P7W0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Senp6Q6P7W0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Senp6Q6P7W0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Senp6Q6P7W0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Senp6Q6P7W0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Senp6Q6P7W0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Senp6Q6P7W0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Senp6Q6P7W0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Senp6Q6P7W0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Senp6Q6P7W0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms