Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C5

Smug1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smug1Q6P5C5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smug1Q6P5C5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms