Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp12Q6P5B0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms