Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Slx4Q6P1D7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms