Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms