Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm4Q6IRU2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms