Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud6aQ6IE21 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms