Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nckap5lQ6GQX2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms