Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rftn1Q6A0D4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms