Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ric1Q69ZJ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ric1Q69ZJ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ric1Q69ZJ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms