Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk13Q69ZA1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk13Q69ZA1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms