Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kiaa1549Q68FD9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kiaa1549Q68FD9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms