Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tm4sf1Q64302 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm4sf1Q64302 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms