Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zfp248Q640N4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp248Q640N4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp248Q640N4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp248Q640N4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp248Q640N4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp248Q640N4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp248Q640N4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp248Q640N4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp248Q640N4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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