Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a5Q63ZW6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms