Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr2kQ63871 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr2kQ63871 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms