Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrhQ62361 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms