Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim28Q62318 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms