Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sall3Q62255 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms