Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema5aQ62217 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5aQ62217 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms