Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ttf1Q62187 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ttf1Q62187 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttf1Q62187 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Ttf1Q62187 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Ttf1Q62187 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Ttf1Q62187 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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Ttf1Q62187 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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