Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm38Q62176 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rbm38Q62176 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rbm38Q62176 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rbm38Q62176 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rbm38Q62176 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rbm38Q62176 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rbm38Q62176 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm38Q62176 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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