Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Lrrn1Q61809 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn1Q61809 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn1Q61809 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms