Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AtrxQ61687 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrxQ61687 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms