Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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PcolceQ61398 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PcolceQ61398 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PcolceQ61398 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PcolceQ61398 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PcolceQ61398 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PcolceQ61398 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PcolceQ61398 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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PcolceQ61398 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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PcolceQ61398 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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PcolceQ61398 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PcolceQ61398 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PcolceQ61398 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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