Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tcf12Q61286 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcf12Q61286 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms