Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc9a1Q61165 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc9a1Q61165 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms