Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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