Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxf1Q61080 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms