Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd3Q61060 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms