Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarb1Q61009 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarb1Q61009 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms