Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms