Protein–RNA interactions for Protein: Q60843

Klf2, Krueppel-like factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf2Q60843 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf2Q60843 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf2Q60843 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms