Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r1bQ60829 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms