Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms