Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CttnQ60598 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CttnQ60598 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CttnQ60598 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CttnQ60598 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CttnQ60598 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms