Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhfpl4Q5U4E0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl4Q5U4E0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms