Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms