Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms