Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms