Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r196Q5SVD5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms