Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms