Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms