Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms