Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smg7Q5RJH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg7Q5RJH6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg7Q5RJH6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg7Q5RJH6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg7Q5RJH6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg7Q5RJH6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg7Q5RJH6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg7Q5RJH6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms